sábado, 31 de enero de 2015

Piruvato Deshidrogenasa

Piruvato Deshidrogenasa
La conexión entre la llamada fase anaeróbica de la glucólisis, en donde se metaboliza la glucosa para convertirla en 2 moléculas de ácido pirúvico, con la fase aeróbica de la glucólisis, que llevará la degradación de la glucosa hasta CO2 y H2O en el Ciclo de Krebs, consiste en la descarboxilación oxidativa del piruvato a Acetil-CoA.
   Esta transformación es catalizada por un complejo multienzimático llamado Piruvato Deshidrogenasa.
-La conversión del piruvato a Acetil-CoA por la acción de la Piruvato Deshidrogenasa es un punto crítico del metabolismo, particularmente en el hígado, puesto que disminuye la posibilidad de que el piruvato se reconvierta en glucosa o en ácido láctico.
-La conversión a Acetil-CoA compromete al piruvato a entrar al Ciclo de Krebs, donde puede ser utilizado como sustrato para la fosforilación oxidativa, o puede ser convertido a citrato para ser exportado al citosol y servir como sustrato para la biosíntesis de ácidos grasos e isoprenoides.
-La descarboxilación oxidativa del piruvato en los organismos anaeróbicos requiere la utilización de un receptor de electrones diferente al NAD+, el cual es frecuentemente una proteína ferro sulfurada.
-La conversión es catalizada por una enzima dependiente de tiamina (vitamina B1) que tambien produce la acilación de la Coenzima-A.
-Los equivalentes reductores son eliminados por la producción de H2 por la actividad de una hidrogenasa.






 Regulación

Por anaplerosis.- La mayor parte del piruvato se oxida a acetil-CoA, pero una cierta cantidad se convierte en oxalacetato (proceso anaplerótico), permitiendo que la acetil-CoA se combine con este último para que el ciclo de Krebs funcione adecuadamente.
Por inhibición competitiva.- Tanto la acetil-CoA como el NADH son inhibidores competitivos; de esta manera, cuando el aporte de acetil-CoA es suficiente a expensas de los ácidos grasos, la enzima es inhibida, evitando así el desperdicio innecesario de piruvato derivado de la glucosa.

REGULACIÓN 2

Por el proceso de fosforilación defosforilación.- Existen dos formas interconvertibles de la piruvato deshidrogenasa: una, fosforilada, o forma inactiva, la otra desfosforilada, es la forma activa.
La intervonversión es catalizada por dos enzimas: la piruvato deshidrogenasa cinasa, que requiere ATP, y la piruvato deshidrogenasa fosfatasa.
Ambas enzimas forman parte del complejo, asociadas a la dihidrolipoil transacetilasa. La principal función reguladora es ejercida por la cinasa que al fosforilar la piruvato deshidrogenasa la convierte en su forma inactiva; esto ocurre cuando hay exceso de ATP en la célula. Cabe destacar el papel estimulador que ejercen sobre la cinasa la acetil-CoA y el NADH, y el papel inhibidor del piruvato y el ADP.


REGULACIÓN 3
Por actividad endócrina.- La actividad del complejo piruvato deshidrogenasa también es regulada por algunas hormonas. De entre ellas cabe destacar la insulina que incrementa la forma activa (desfosforilada) en tejido adiposo; Las catecolaminas como la adrenalina pueden activar la piruvato deshidrogenasa en el tejido cardiaco.



Problemario de cinetica enzimatica

Problemario de cinetica enzimatica

1.Se midió la cinética de una enzima en función de la concentración de sustrato.  Los resultados obtenidos se muestra en la siguiente tabla:

Concentración de
Sustrato (μM)

Velocidad (mM/min)
3
10.4
5
14.5
10
22.5
30
33.8
90
40.5

Dibuja las gráficas de Michaelin-Menten y Lineweaver-Burk correspondientes.
¿Calcule cuáles son los valores de  Vmax  y KM .?.
¿Dibuja también, cómo sería la gráfica si a la reacción se le adicionara un inhibidor acompetitivo?

2. Los siguientes datos experimentales se recogieron durante el estudio de la actividad catalítica de una pepsidasa intestinal capaz de hidrolizar el dipéptido glicilglicina.

(S) mM
Velocidad (mM/min)
1.5
0.21
2.0
0.24
3.0
0.28
4.0
0.33
8.0
0.40
16.0
0.45
A partir de estos datos determina por análisis gráfico los valores de KM y Vmax para esta preparación enzima sustrato.

3. Se midió la velocidad de una reacción catalizada por una enzima en función de la concentración de sustrato en presencia y ausencia de un inhibidor. Los resultados obtenidos se muestra en la siguiente tabla:

Concentración de
Sustrato (μM)
Velocidad  (μM /min)
Sin inhibidor
Con inhibidor
3
10.4
4.1
5
14.5
6.4
10
22.5
11.3
30
33.8
22.6
90
40.5
33.8
Dibuje las gráficas de Lineweaver-Burk correspondientes
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en ausencia del inhibidor?.
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en presencia del inhibidor?
¿De qué tipo de inhibidor se trata?

4. La deshidrogenasa 6-fosfoglucónica cataliza la descarboxilación oxidativa del ácido 6 fosfoglucónico. Con los datos obtenidos experimentalmente que se muestran en la tabla, determina el efecto que causa sobre esta enzima el colorante rosa de bengala.
Concentración de
Sustrato (μM)
Velocidad  (μM /min)
Sin coloranter
Con colorante
3
2.29
1.83
5
3.20
2.56
7
3.86
3.09
9
4.36
3.49
11
4.75
3.80
Dibuje las gráficas de Lineweaver-Burk correspondientes
¿Cuáles son los valores de Vmax  y KM en presencia del colorante?
¿Se puede considerar como inhibidor al colorante, si así es, de qué tipo.

5. Se midió la cinética de una enzima en función de la concentración de sustrato en presencia y ausencia de un inhibidor. Los resultados obtenidos se muestra en la siguiente tabla:
Concentración de
Sustrato (μM)
Velocidad  (μM /min)
Sin inhibidor
Con inhibidor
3
2.29x103
1.83x103
5
3.20x103
2.56x103
7
3.86x103
3.09x103
9
4.36x103
3.49x103
11
4.75x103
3.80x103

Dibuje las gráficas de Lineweaver-Bruk correspondientes
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en ausencia del inhibidor?.
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en presencia del inhibidor?
¿De qué tipo de inhibidor se trata?.

6. Los datos que se muestran a continuación se obtuvieron de una reacción bioquímica catalizada por una enzima. La reacción se llevó a cabo en presencia y ausencia de un inhibidor (I):


V(mmol mL-1 min-1
[S](mM)
Sin (I)
Con (I)
0.2
5.0
3.0
0.4
7.5
5.0
0.8
10.0
7.5
1.0
10.7
8.3
2.0
12.5
10.7
4.0
13.6
12.5
Dibuje las gráficas de Lineweaver-Bruk correspondientes
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en ausencia del inhibidor?.
¿Cuáles son los valores de  Vmax  y KM en presencia del inhibidor?

Explique el comportamiento del inhibidor (I),  ¿se combina con la enzima o , con el complejo ES o con los dos?